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中美倡議啟動(dòng)“地球生物基因組計劃”

    在美國斯密森尼生物多樣性基因組學(xué)項目組與中國華大基因公司近日聯(lián)合主辦的生物基因組學(xué)會(huì )議（BioGenomics2017）閉幕論壇上，加州大學(xué)戴維斯分校基因組學(xué)家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學(xué)家張國捷等組成的科研團隊聯(lián)合倡議，全球科學(xué)家合作開(kāi)啟另一項與人類(lèi)基因組計劃（HGP）類(lèi)似的項目——地球生物基因組計劃（EBP），對地球上所有真核生物進(jìn)行測序。

    據《科學(xué)》雜志官網(wǎng)報道，EBP計劃大約兩年前第一次提出，將著(zhù)重對包括所有植物、動(dòng)物和單細胞生物在內的真核生物群體進(jìn)行測序。倡議團隊估計，得益于測序技術(shù)的進(jìn)步和成本下降，可能只需10年時(shí)間以及與HGP相當的費用（約27億美元），就能完成對全部真核生物的測序。

    現有EBP框架大約分三步完成：第一步，為9000個(gè)真核生物科中的每科選出一個(gè)代表進(jìn)行DNA測序，獲得的參考基因組要與人類(lèi)基因組相當或更好；第二步，對15萬(wàn)到20萬(wàn)個(gè)真核生物屬中每個(gè)屬選取一個(gè)物種測序，詳細程度不需達到第一步的標準；第三步，對150萬(wàn)個(gè)真核生物物種進(jìn)行粗略性測序。

    項目倡議人員表示，EBP已經(jīng)取得良好開(kāi)端，好幾個(gè)測序項目已經(jīng)啟動(dòng)，包括為1萬(wàn)種脊椎動(dòng)物進(jìn)行基因組測序的基因組10K項目、破譯5000種節肢動(dòng)物基因組的i5K項目、為1萬(wàn)多種禽類(lèi)物種測序基因組的B10K項目等。“我們就是要把EBP打造成‘戰斗機中的戰斗機’。”萊文說(shuō)。

    在會(huì )議上，中國華大基因和英國韋爾科姆基金會(huì )桑格研究所等基因組學(xué)領(lǐng)頭企業(yè)，表明了積極參與的立場(chǎng)，但EBP項目目前仍面臨重大挑戰：一是因生物多樣性問(wèn)題，只有更多發(fā)展中國家參與并開(kāi)展更加國際化的合作，該項目才能最終成型；二是制定高質(zhì)量測序和保存有機體樣本的標準，其中因現有博物館動(dòng)植物樣品的保存方式不符合要求，或需要大量的野外采集樣品，這可能耗費很大成本。